نرم افزار پیش بینی و مدلسازی داکینگ مولکولی Molegro Virtual Docker v6.0

نرم افزار مدلسازی داکینگ مولکولی Molegro Virtual Docker ، داکینگ (Docking) روشی است که جهت گیری ترجیحی (Preferred orientation) یک مولکول نسبت به دیگری را زمانی که به یکدیگر متصل می شوند تا کمپلکسی پایدار را شکل دهند، پیشگویی می کند.
به عبارتی روش کلیدی در پیش بینی ساختار کمپلکس رسپتور-لیگاند در فرایند کشف داروها و ترکیبات پیشرو جدید، داکینگ مولکولی نامیده می شود.

نرم افزار Molegro Virtual Docker نرم افزاری برای بصری سازی فرآیند داکینگ و پیش بینی تعاملات لیگاند پروتئینی است.

در فرایند داکینگ، محله ی اول، مرحله نمونه­ گیری است که شامل ایجاد کانفورماسیون­ های مختلف لیگاند و بررسی جهت­ گیری آن ها نسبت به جایگاه فعال رسپتور است و در مرحله بعدی که امتیازدهی نامیده می شود، تمایل اتصال لیگاند به رسپتور تخمین زده می شود.

در محیط گرافیکی که این نرم افزار برای کاربر فراهم می کند، می توانید تمام جنبه های فرآیند شکل گیری لیگاندهای پروتئینی از آماده سازی مولکول گرفته تا تعیین مکان های بالقوه اتصال پروتئین مورد نظر و پیش بینی حالت اتصال لیگاندها را بررسی و مدیریت کنید.

در واقع نرم افزار Molegro Virtual Docker بر اساس یک روش بهینه سازی یک اتصال با کیفیت بالا و بهینه را که بر مبنای تکنولوژی ها و تکنیک های جدید، محاسبه شده است را ارائه می دهد.

این در حالی است که رابط کاربری آن به گونه ای طراحی شده است تا در عین کارایی داشتن و ارائه ی نتایج پیشرفته، برای کاربرانش به راحتی قابل استفاده باشد.

نرم افزار موبایل آزمایشگاه مجازی شیمی BEAKER - Mix Chemicals

قابلیت های نرم افزار مدلسازی داکینگ مولکولی Molegro Virtual Docker:

  • پیش بینی حالت اتصال لیگاندها
  • دقت بالا در شناسایی درست اتصالات
  • تعیین مکان های بالقوه اتصال پروتئین
  • تشخیص  یک اتصال بهینه بر مبنای تکنولوژی های جدید
  • رابط کاربری قابل فهم

 

Molegro Virtual Docker

Molegro Virtual Docker is an integrated platform for predicting protein ligand interactions. Molegro Virtual Docker handles all aspects of the docking process from preparation of the molecules to determination of the potential binding sites of the target protein, and prediction of the binding modes of the ligands.

Molegro Virtual Docker offers high-quality docking based on a novel optimization technique combined with a user interface experience focusing on usability and productivity.

The Molegro Virtual Docker (MVD) has been shown to yield higher docking accuracy than other state-of-the-art docking products (MVD: 87%, Glide: 82%, Surflex: 75%, FlexX: 58%).

Molegro Virtual Docker provides:

– High docking accuracy: the docking engine has been proven to correctly identify binding modes with high accuracy. Molegro Virtual Docker has been shown to outperform other docking programs with regard to identification of correct binding modes (see the technology pages for more information).

– Easy-to-use interface: the built-in wizards enable the user to easily setup and perform docking runs. Advanced visualization and analysis tools are provided to examine ligand-receptor interactions and fine-tune found docking solutions.

– Cross-platform: supported on Linux, Windows and Mac, allowing easy interoperability between platforms.

 

راهنمای نصب

۱- نرم افزار را نصب کنید.
۲- محتویات پوشه Cracked file را در محل نصب نرم افزار کپی و جایگزین فایل (های) قبلی کنید.
۳- نرم افزار را اجرا کنید.

فرمول نویسی در Word با MathType 6.9a

محل نصب نرم افزار: پوشه محل نصب معمولاً در درایو ویندوز و داخل پوشه Program Files قرار دارد.

همچنین با این روش می توانید محل نصب را پیدا کنید:

در ویندوز XP: بعد از نصب، روی Shortcut نرم افزار در منوی Start کلیک راست کرده و روی گزینه Properties و سپس روی گزینه Find Target کلیک کنید.

در ویندوز ۷: بعد از نصب، روی Shortcut نرم افزار در منوی Start کلیک راست کرده و روی گزینه Open file location کلیک کنید.

در ویندوز ۸: بعد از نصب، روی Shortcut نرم افزار در صفحه Start Screen کلیک راست کرده و روی گزینه Open file location کلیک کنید، در پنجره ایی که باز می شود مجدداً روی Shortcut نرم افزار کلیک راست کنید و روی گزینه Open file location کلیک کنید.

در ویندوز ۱۰: بعد از نصب، روی Shortcut نرم افزار در منوی Start کلیک راست کرده و روی گزینه Open file location کلیک کنید، در پنجره ایی که باز می شود مجدداً روی Shortcut نرم افزار کلیک راست کنید و روی گزینه Open file location کلیک کنید.

 

لینک دانلود نرم افزار پیش بینی و مدلسازی داکینگ موکولی Molegro Virtual Docker v6.0

حجم فایل: ۲۰٫۶ مگابایت

پسورد: www.chemgroup.ir

شرکت سازنده: CLC bio

مقالات مرتبط

پاسخ‌ها

sed leo. nunc odio mi, libero at Sed commodo id ultricies venenatis